В начале июля 1941 года Михаил Пилипенко вместе с отцом добровольно ушёл на фронт. Уже через две недели под Козельском принял первый бой с вражеским авиадесантом и получил ранение. В ноябре 1941 года он участвовал в знаменитом параде на Красной площади в Москве.

В дальнейшем Пилипенко воевал на нескольких фронтах, участвовал в битве за Москву, обороне Ленинграда и Курской битве. Особо отличился во время битвы за Днепр, где в сентябре 1943 года трижды форсировал реку. Под огнём противника связист-разведчик обеспечивал связь подразделений своего полка.

Во время освобождения Киева Михаил Пилипенко оказался с радиостанцией в тылу врага. Для ликвидации прорыва противника он вызвал огонь на себя.

За мужество и героизм при форсировании Днепра 29 октября 1943 года Михаилу Корнеевичу Пилипенко было присвоено звание Героя Советского Союза.

После войны он продолжил военную службу, окончил военное училище связи и Военную академию связи. С 1973 по 1988 год возглавлял Киевское высшее военное инженерное училище связи, где занимался совершенствованием подготовки будущих офицеров.

В 1986 году Пилипенко участвовал в ликвидации последствий аварии на Чернобыльской АЭС. После выхода на пенсию активно занимался ветеранской деятельностью, писал книги и участвовал в создании фильмов.

Михаил Корнеевич Пилипенко скончался 24 ноября 2009 года в Москве.

Его жизнь - пример мужества, стойкости и верности воинскому долгу, а его подвиг на Днепре навсегда остался частью истории Великой Отечественной войны.